A Coleção de Leptospira, CLEP, está alocada no Laboratório de Referência Nacional para Leptospirose / Centro Colaborador da Organização Mundial da Saúde (OMS) e dentre suas atividades destacam-se a preservação, o armazenamento, o fornecimento, a caracterização taxonômica e a identificação de Leptospira spp., contribuindo assim para o desenvolvimento científico e tecnológico do Brasil e de outros países.

Poucos laboratórios no mundo possuem coleção semelhante, em virtude dos custos e das dificuldades de manutenção de bactérias do gênero Leptospira, devido ao seu crescimento fastidioso in vitro.

As cepas de referência presentes no acervo da CLEP são réplicas de acervos de outras coleções internacionais, vinculadas a Centros Colaboradores da OMS, compreendendo inúmeros sorovares já identificados para este gênero bacteriano. Há também cepas que foram isoladas a partir de amostras clínicas humanas e animais, bem como do ambiente. Trata-se de espécimes representativos de sorovares circulantes em território brasileiro e em outros países, principalmente da América Latina. Estas linhagens são amplamente utilizadas em estudos relacionados à epidemiologia da leptospirose, especialmente aqueles relacionados ao conceito da Saúde Única. Além disso, há um potencial de bioprospecção considerando-se a possibilidade do desenvolvimento de kits diagnósticos e vacinas baseados em antígenos de superfície das espécies patogênicas do gênero Leptospira.

De forma geral, a CLEP, além de um acervo biológico, é um ambiente de ensino e pesquisa, com o compromisso de apoiar o Brasil e outros países em todas as situações que envolvam questões relacionadas à leptospirose, bem como investir no aprimoramento de outros centros de pesquisa e na multiplicação do conhecimento sobre a leptospirose.

No ano de 2011 a CLEP, foi reconhecida institucionalmente pela Fiocruz, e em 2012 filiou-se à World Federation for Culture Collections, WFCC, sob o registro WDCM 1012.